264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1948 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  89.6 
 
 
448 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.55 
 
 
540 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.8 
 
 
540 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
474 aa  950    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  99.34 
 
 
456 aa  910    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  90.52 
 
 
465 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  79.55 
 
 
540 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.34 
 
 
543 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  77.13 
 
 
433 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  88.57 
 
 
461 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  89.11 
 
 
448 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  88.57 
 
 
461 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  88.33 
 
 
436 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.55 
 
 
540 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.55 
 
 
540 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  79.55 
 
 
540 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  89.68 
 
 
458 aa  747    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.55 
 
 
540 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  66.67 
 
 
449 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  69.31 
 
 
446 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  69.58 
 
 
446 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.49 
 
 
196 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  100 
 
 
220 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.31 
 
 
429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  41.71 
 
 
441 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  44.47 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  41.9 
 
 
461 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  41.65 
 
 
468 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  41.39 
 
 
471 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.46 
 
 
460 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  41.13 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  41.44 
 
 
424 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.13 
 
 
471 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.13 
 
 
471 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.13 
 
 
471 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.2 
 
 
374 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.5 
 
 
433 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  41.22 
 
 
461 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  42.03 
 
 
461 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  38.98 
 
 
455 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  41.76 
 
 
449 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  41.76 
 
 
449 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  42.05 
 
 
449 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.46 
 
 
525 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  35.55 
 
 
472 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  40.82 
 
 
435 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  35.8 
 
 
472 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  35.08 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.18 
 
 
413 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
536 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
536 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.47 
 
 
462 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
536 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
536 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.23 
 
 
540 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  35.68 
 
 
473 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  35.76 
 
 
473 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  35.68 
 
 
473 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  44.48 
 
 
454 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  37.22 
 
 
480 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  37.4 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  35.19 
 
 
473 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.19 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.42 
 
 
476 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  37.76 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  37.5 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  33.87 
 
 
491 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.69 
 
 
451 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
390 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.74 
 
 
353 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  35.43 
 
 
422 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  34.39 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 
361 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.93 
 
 
393 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 
387 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.85 
 
 
419 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.24 
 
 
451 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.87 
 
 
626 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  29.68 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  27.13 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  30.05 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.67 
 
 
311 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
346 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 
613 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  27.82 
 
 
348 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  26.22 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
379 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25.47 
 
 
594 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.7 
 
 
369 aa  93.6  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.9 
 
 
594 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.28 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  26.68 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.93 
 
 
598 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 
399 aa  90.5  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  29.57 
 
 
345 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 
768 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.12 
 
 
431 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>