267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1696 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 433 aa  883    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  58.38 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  55.97 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  55.14 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  55.14 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  54.64 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  54.42 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  53.44 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  53.44 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  49.65 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  52.96 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  52.96 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  52.96 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  52.96 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  52.96 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  53.44 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  51.9 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  52.96 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  50.11 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  52.39 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  53.44 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  53.85 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  53.85 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  53.83 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  45.65 
 
 		 454 aa  338  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  44.64 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  43.47 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  44.39 
 
 		 473 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.02 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  43.65 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  44.39 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  44.39 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  44.13 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.85 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  44.09 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.33 
 
 		 536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.08 
 
 		 536 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.08 
 
 		 536 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.08 
 
 		 536 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.64 
 
 		 540 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.01 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  40.55 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.17 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.95 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.15 
 
 		 543 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  39.9 
 
 		 540 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.75 
 
 		 540 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.75 
 
 		 540 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.75 
 
 		 540 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.75 
 
 		 540 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.75 
 
 		 540 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  39.5 
 
 		 540 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  40.8 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  40.64 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  41.18 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  38.77 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  38.53 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  38.53 
 
 		 461 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  40.37 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  39.25 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  36.26 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.5 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  39.75 
 
 		 449 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.63 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  37.87 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.62 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  34.67 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.11 
 
 		 196 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.02 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  30.89 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  29.67 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.05 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  32.13 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  31.45 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  32.89 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  30.72 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.68 
 
 		 346 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.16 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  30.31 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.52 
 
 		 594 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  29.53 
 
 		 571 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.76 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.16 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  25.68 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 		 311 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.65 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  29.95 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.47 
 
 		 768 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.18 
 
 		 333 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  27.89 
 
 		 626 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  27.95 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  26.56 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  26.48 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  27.93 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  29.39 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>