255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1042 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  75.56 
 
 
473 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.25 
 
 
536 aa  1075    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.25 
 
 
536 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  97.55 
 
 
540 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  74.67 
 
 
473 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  78.57 
 
 
449 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  84.7 
 
 
525 aa  828    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
536 aa  1084    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  75.56 
 
 
473 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  76.05 
 
 
472 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  75.56 
 
 
473 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  77.42 
 
 
472 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.25 
 
 
536 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  65.4 
 
 
480 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  62.53 
 
 
480 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  57.6 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  52.24 
 
 
454 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  49.39 
 
 
455 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  49.87 
 
 
428 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  48.88 
 
 
463 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  48.88 
 
 
463 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  49.49 
 
 
471 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  49.23 
 
 
467 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.23 
 
 
471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.23 
 
 
471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.23 
 
 
471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50 
 
 
374 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  48.98 
 
 
468 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  48.14 
 
 
441 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.08 
 
 
460 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  46.06 
 
 
429 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  46.39 
 
 
461 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  48.47 
 
 
461 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  47.96 
 
 
469 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  46.43 
 
 
461 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  46.94 
 
 
435 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  46.68 
 
 
449 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  46.68 
 
 
449 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  46.68 
 
 
449 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.96 
 
 
462 aa  333  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  41.27 
 
 
424 aa  319  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.33 
 
 
476 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.85 
 
 
433 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.2 
 
 
468 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.95 
 
 
454 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.26 
 
 
413 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  37.47 
 
 
491 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.84 
 
 
543 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.64 
 
 
433 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  38.37 
 
 
540 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.37 
 
 
540 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.37 
 
 
540 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.37 
 
 
540 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.37 
 
 
540 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.37 
 
 
540 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.37 
 
 
540 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 
436 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 
461 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 
461 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  37.68 
 
 
465 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  37.44 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  37.44 
 
 
448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.59 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  36.14 
 
 
446 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  37.59 
 
 
456 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  37.19 
 
 
448 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.14 
 
 
446 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  36.46 
 
 
449 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  35.19 
 
 
390 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.67 
 
 
196 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  30.54 
 
 
378 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.25 
 
 
353 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.31 
 
 
361 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  31.47 
 
 
422 aa  140  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  29.89 
 
 
393 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.87 
 
 
451 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.63 
 
 
419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  33.64 
 
 
387 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  26.95 
 
 
384 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  26.26 
 
 
453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 
431 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  23.93 
 
 
613 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.03 
 
 
487 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.09 
 
 
328 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25.45 
 
 
594 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
379 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.04 
 
 
768 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 
417 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  25.41 
 
 
333 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  26.2 
 
 
371 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 
331 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  27.32 
 
 
331 aa  98.6  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  28.64 
 
 
353 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  27.91 
 
 
343 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  25.27 
 
 
333 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  25.56 
 
 
592 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 
369 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.33 
 
 
311 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1028  hypothetical protein  27.73 
 
 
529 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743991  normal  0.0101542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>