268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3802 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  52.72 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  51.24 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  51.74 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  51.74 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  51.74 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50.75 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  51.24 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  51.24 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  51.24 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  51.74 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  50.25 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  51 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  51.49 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  46.77 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  51.24 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  51.12 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  45.91 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.89 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  44.31 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  44.2 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.81 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.07 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.07 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.94 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  43.11 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  42.66 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  41.63 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  42.68 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  43.83 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  42.43 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.43 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.43 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.43 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.07 
 
 		 374 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  42.18 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.8 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  43.58 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  43.58 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.28 
 
 		 413 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  43.07 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  43.58 
 
 		 449 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.61 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  42.32 
 
 		 454 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  42.82 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.69 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  35.95 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  37.91 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.21 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.01 
 
 		 543 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  36.49 
 
 		 449 aa  249  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.27 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  38.27 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.42 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  38.18 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.18 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.18 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.18 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.18 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.18 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  37.93 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  36.74 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  36.74 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.22 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  36.68 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.46 
 
 		 196 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  29.98 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  31.07 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  29.98 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  29.6 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  29.3 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  27.46 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  29.5 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.44 
 
 		 487 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  27.85 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.43 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.54 
 
 		 768 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  29.95 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.5 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.87 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  33.1 
 
 		 594 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.57 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.34 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.04 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  28.05 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  27.68 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.96 
 
 		 311 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 		 594 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  27.53 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  29.09 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  29.09 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  29.51 
 
 		 571 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  31.75 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>