248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1890 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  80.49 
 
 
448 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.26 
 
 
540 aa  1063    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.63 
 
 
540 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.27 
 
 
474 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  80 
 
 
456 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  80.35 
 
 
465 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  89.5 
 
 
543 aa  803    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  99.26 
 
 
540 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  75.49 
 
 
433 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  80.89 
 
 
461 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  80.4 
 
 
436 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  80.69 
 
 
448 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  80.89 
 
 
461 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.26 
 
 
540 aa  1063    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  80.98 
 
 
458 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.26 
 
 
540 aa  1063    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.26 
 
 
540 aa  1063    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
540 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  70.8 
 
 
449 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  67.82 
 
 
446 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  67.55 
 
 
446 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.33 
 
 
196 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  78.43 
 
 
220 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.83 
 
 
429 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 
463 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 
463 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  41.34 
 
 
441 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  42.11 
 
 
469 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.75 
 
 
433 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  41.36 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  42.9 
 
 
461 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  40.26 
 
 
455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  39.05 
 
 
473 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  38.9 
 
 
472 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  38.52 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.15 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  38.81 
 
 
473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  38.81 
 
 
473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  39.74 
 
 
468 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 
471 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  39.23 
 
 
467 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  38.6 
 
 
472 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.23 
 
 
471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.23 
 
 
471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.23 
 
 
471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.14 
 
 
536 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.14 
 
 
536 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.14 
 
 
536 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.14 
 
 
536 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.8 
 
 
460 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.05 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.79 
 
 
540 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.9 
 
 
480 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  40.1 
 
 
449 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  37.66 
 
 
473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  39.66 
 
 
435 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  39.47 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  40.1 
 
 
449 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  40.1 
 
 
449 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  37.19 
 
 
454 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.97 
 
 
462 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  36.65 
 
 
480 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  38.23 
 
 
454 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.66 
 
 
476 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.46 
 
 
468 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.2 
 
 
413 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  37.03 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.44 
 
 
451 aa  210  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  34.03 
 
 
491 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  37.08 
 
 
390 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.51 
 
 
353 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  32.82 
 
 
393 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 
361 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  32.53 
 
 
461 aa  163  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  35.54 
 
 
387 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.79 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 
311 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  31.61 
 
 
357 aa  114  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  30.39 
 
 
417 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.54 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  28.24 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.21 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.4 
 
 
626 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.1 
 
 
613 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.85 
 
 
369 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  26.37 
 
 
348 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  24.59 
 
 
594 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.62 
 
 
379 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  26.47 
 
 
662 aa  90.5  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  28.2 
 
 
336 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.93 
 
 
487 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 
768 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.43 
 
 
594 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.08 
 
 
616 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  25.82 
 
 
302 aa  87.4  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  26.77 
 
 
626 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.65 
 
 
399 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  24.66 
 
 
328 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>