263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5888 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
429 aa  880    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  59.11 
 
 
460 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  61.32 
 
 
468 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  61.05 
 
 
467 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  61.05 
 
 
471 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  61.05 
 
 
471 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  61.05 
 
 
471 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  60.79 
 
 
471 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  62.81 
 
 
374 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  61.87 
 
 
461 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  60.9 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  60.11 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  58.42 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  60.37 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  58.24 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  55.92 
 
 
463 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  57.11 
 
 
449 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  57.11 
 
 
449 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  57.11 
 
 
449 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  55.92 
 
 
463 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  54.82 
 
 
441 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  51.95 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  52.62 
 
 
455 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  51.99 
 
 
424 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  45.73 
 
 
428 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.31 
 
 
525 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.06 
 
 
536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.8 
 
 
536 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.8 
 
 
536 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.8 
 
 
536 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.34 
 
 
540 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  45.16 
 
 
472 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  44.83 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  44.96 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  44.96 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.39 
 
 
480 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  44.72 
 
 
473 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 
473 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  46.9 
 
 
451 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  41.97 
 
 
480 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  45.22 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  43.32 
 
 
454 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.29 
 
 
476 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.72 
 
 
543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.82 
 
 
413 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  42.56 
 
 
468 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.83 
 
 
540 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  43.83 
 
 
540 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  43.83 
 
 
540 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  44.47 
 
 
461 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  44.47 
 
 
461 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.57 
 
 
540 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.57 
 
 
540 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.57 
 
 
540 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.57 
 
 
540 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  44.74 
 
 
448 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  39.95 
 
 
449 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  42.3 
 
 
454 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  43.95 
 
 
436 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  44.74 
 
 
465 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  43.6 
 
 
458 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.89 
 
 
433 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  41.41 
 
 
446 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  44.47 
 
 
448 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.31 
 
 
474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  43.31 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.62 
 
 
446 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  35.36 
 
 
491 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  38.65 
 
 
390 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50.28 
 
 
196 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  34.65 
 
 
378 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  36.64 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  35.24 
 
 
422 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  33.07 
 
 
387 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.68 
 
 
393 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  32.6 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.96 
 
 
451 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  31.5 
 
 
357 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.28 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  31.35 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 
311 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.17 
 
 
346 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.93 
 
 
369 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 
431 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 
431 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.75 
 
 
487 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.13 
 
 
594 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.22 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  27.8 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  28.68 
 
 
343 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  28.73 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.98 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  29.68 
 
 
401 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  37.85 
 
 
220 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  29 
 
 
592 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.95 
 
 
613 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.1 
 
 
365 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 
359 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>