271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1422 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 378 aa  777    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  55.59 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  53.31 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  40.86 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  41.34 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  37.46 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  37.56 
 
 		 422 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.41 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.28 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  34.59 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.83 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  34.91 
 
 		 419 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  35.6 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.93 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.93 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.93 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.93 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.93 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  34.93 
 
 		 540 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  35.71 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  35.62 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  35.62 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.62 
 
 		 436 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.65 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 		 540 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.55 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.39 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  35.81 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  34.39 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  33.17 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  34.56 
 
 		 465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  35.19 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  35.18 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  34.92 
 
 		 467 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.73 
 
 		 460 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  34.39 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.92 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.92 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.92 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.92 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  33.79 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.42 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.6 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.54 
 
 		 536 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.24 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.54 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.54 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.54 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  33.88 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.96 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  32.97 
 
 		 455 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.24 
 
 		 540 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  33.82 
 
 		 469 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  31 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.78 
 
 		 463 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.78 
 
 		 463 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  34.3 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.14 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  32.02 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.02 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  31.02 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.91 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  30.33 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.48 
 
 		 480 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  29.6 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  29.88 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 		 594 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  29.1 
 
 		 454 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.1 
 
 		 768 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  32 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  31.75 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.92 
 
 		 437 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  29.18 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  28.93 
 
 		 473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  31.64 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  31.64 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  31.64 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  34.03 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  31.27 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.4 
 
 		 346 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.87 
 
 		 476 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.17 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  31.09 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  29.71 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  32.85 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  32.98 
 
 		 626 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.18 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>