270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1313 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  85.68 
 
 		 461 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  93.53 
 
 		 449 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  80.8 
 
 		 461 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  93.09 
 
 		 449 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  82.09 
 
 		 469 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  93.09 
 
 		 449 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 435 aa  886    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.66 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.66 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.66 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  77.66 
 
 		 467 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  77.6 
 
 		 471 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  77.14 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  68.41 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.36 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  72.87 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  76.06 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  56.33 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  56 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  56 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  57.56 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  57.29 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  53.44 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  52.88 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  48.74 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.45 
 
 		 480 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.09 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  47.86 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.82 
 
 		 536 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  47.25 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.56 
 
 		 536 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.56 
 
 		 536 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  48.59 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  47.25 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  47.25 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.56 
 
 		 536 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  47.25 
 
 		 473 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.1 
 
 		 540 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  46.25 
 
 		 472 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  46.02 
 
 		 473 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.84 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.56 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  41.49 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  39.68 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.44 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.6 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.34 
 
 		 413 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.07 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  39.81 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  39.81 
 
 		 461 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  39.81 
 
 		 461 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  40.41 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  40.92 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  40.7 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  40.66 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.92 
 
 		 474 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  39.66 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  37.61 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.66 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  39.66 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  40 
 
 		 458 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.41 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.41 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.21 
 
 		 543 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.41 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.41 
 
 		 540 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  39.18 
 
 		 446 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.66 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  34.3 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50.56 
 
 		 196 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 		 361 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  32.31 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  30.05 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.02 
 
 		 357 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.08 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.71 
 
 		 346 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.29 
 
 		 419 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  31.05 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  28.98 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.73 
 
 		 626 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.89 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  29.22 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.06 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.01 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  28.06 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  29.01 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  28.17 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  28.75 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  27.98 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  27.46 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 		 340 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  28.76 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  26.13 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>