257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1769 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
422 aa  872    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  57.11 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  51.63 
 
 
453 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  47.23 
 
 
451 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  46.43 
 
 
487 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  47.15 
 
 
390 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  39.51 
 
 
361 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  36.6 
 
 
353 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  37.56 
 
 
378 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1028  hypothetical protein  34.02 
 
 
529 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743991  normal  0.0101542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  36.89 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  36 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  35.71 
 
 
461 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  35.71 
 
 
461 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.05 
 
 
413 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  33.74 
 
 
449 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  35.81 
 
 
465 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 
433 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.53 
 
 
543 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.55 
 
 
436 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 
540 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  37.56 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  35.01 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
540 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
540 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
540 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
540 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.78 
 
 
540 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.43 
 
 
474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  35.43 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  34.53 
 
 
540 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  34.76 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  35.77 
 
 
441 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  34.76 
 
 
458 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  38.2 
 
 
387 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  32.74 
 
 
446 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.74 
 
 
446 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  33.66 
 
 
455 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.25 
 
 
480 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  31.07 
 
 
454 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.24 
 
 
429 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.49 
 
 
525 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.84 
 
 
463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.84 
 
 
463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  33.66 
 
 
424 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  32.94 
 
 
469 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  32.94 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  32.45 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.07 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31 
 
 
536 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  33.01 
 
 
471 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.36 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  32.77 
 
 
467 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.36 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  32.69 
 
 
468 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.36 
 
 
536 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.77 
 
 
471 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.77 
 
 
471 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.77 
 
 
471 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.77 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.08 
 
 
540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  32.7 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  32.61 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  32.89 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  31.44 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  30.47 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  31.58 
 
 
449 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  31.58 
 
 
449 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  31.21 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  31.34 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 
473 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 
473 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 
473 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 
473 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.45 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.29 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  30.79 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.66 
 
 
476 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  31.37 
 
 
435 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  29.92 
 
 
369 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 
594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
373 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 
365 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.68 
 
 
431 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.22 
 
 
311 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.65 
 
 
626 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  33.03 
 
 
607 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 
336 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.56 
 
 
333 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.06 
 
 
379 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
626 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  29.18 
 
 
401 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.5 
 
 
417 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  28.01 
 
 
592 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.72 
 
 
431 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 
768 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  29.07 
 
 
598 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.45 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>