271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4736 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 387 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  51.17 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  50.63 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  37.8 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  41.74 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  39.2 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.63 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.63 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  36.63 
 
 		 454 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  36.96 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.83 
 
 		 540 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  36.56 
 
 		 540 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.83 
 
 		 540 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.83 
 
 		 540 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  36.83 
 
 		 540 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.83 
 
 		 540 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.83 
 
 		 540 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  33.76 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.76 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.53 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  36.24 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.01 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.88 
 
 		 543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  34.85 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  35.68 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.13 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  34.95 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  36.8 
 
 		 458 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  35.41 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  35.41 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.41 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  34.75 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  34.48 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  32.82 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  32.91 
 
 		 449 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.24 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  34.24 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.67 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  33.25 
 
 		 424 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  34.09 
 
 		 446 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.12 
 
 		 525 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.55 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  32.34 
 
 		 473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  32.34 
 
 		 473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  31.41 
 
 		 472 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  31.5 
 
 		 472 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  33.14 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  31.84 
 
 		 473 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  32.05 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  32.05 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  32.05 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.05 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.05 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  30.14 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.05 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.38 
 
 		 453 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  32.14 
 
 		 461 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.29 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  34.75 
 
 		 428 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 		 594 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.28 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 		 536 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.03 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  33.16 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  32.11 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  31.71 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  32.53 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33.01 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33.01 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  31.51 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33.01 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  32.08 
 
 		 626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  32.79 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  30.92 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.08 
 
 		 462 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.53 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 449 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 449 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  30.75 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  27.51 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.2 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  31.35 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  32.29 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.77 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  28.32 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.03 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 		 521 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30.47 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  29.82 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>