More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2378 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
346 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  45.93 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  45.66 
 
 
336 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  41.25 
 
 
333 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  44.09 
 
 
353 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  44.29 
 
 
328 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  38.68 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 
302 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  38.8 
 
 
379 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  38.2 
 
 
369 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.27 
 
 
357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  39.87 
 
 
334 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 
768 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  38.03 
 
 
365 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 
335 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  40.13 
 
 
346 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 
352 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  38.03 
 
 
352 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  38.06 
 
 
431 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  38.03 
 
 
352 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  38.94 
 
 
352 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.92 
 
 
346 aa  205  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  38.14 
 
 
346 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  39.63 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  39.1 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  37.18 
 
 
331 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  37.34 
 
 
345 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  38.02 
 
 
346 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  37.82 
 
 
350 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  35.29 
 
 
352 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  35.76 
 
 
333 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.35 
 
 
346 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  35.93 
 
 
342 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 
339 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  35.24 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 
371 aa  189  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.21 
 
 
353 aa  188  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  34.77 
 
 
352 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 
333 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 
355 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  34.6 
 
 
384 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  38.12 
 
 
347 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  38.12 
 
 
347 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  38.6 
 
 
311 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
349 aa  185  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  38.01 
 
 
347 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  34.71 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  35.9 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  37.87 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  34.83 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 
340 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
358 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 
521 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  36.63 
 
 
377 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  35.13 
 
 
359 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  36.23 
 
 
383 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.93 
 
 
330 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 
345 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.65 
 
 
626 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  36.82 
 
 
333 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  38.18 
 
 
348 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  35.07 
 
 
399 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  35.49 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.97 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 
330 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.43 
 
 
459 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.43 
 
 
459 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.43 
 
 
459 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 
417 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
330 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 
345 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.83 
 
 
473 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.66 
 
 
333 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  34.91 
 
 
397 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  36.03 
 
 
431 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 
347 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  34.64 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  35.88 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
333 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 
377 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  35.22 
 
 
464 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 
594 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32 
 
 
398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  31.15 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  34.81 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  33.97 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  34.33 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  36.03 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.12 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  36.03 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.68 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 
344 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  34.12 
 
 
344 aa  162  9e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 
384 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 
344 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 
344 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>