293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5340 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 377 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  63.88 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  40.39 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  40.73 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  39.94 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  39.88 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 357 aa  225  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  39.64 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  38.81 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  37.43 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  40.49 
 
 		 345 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  38.21 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  38.96 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  36.12 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.47 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.18 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  33.88 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  36.56 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  37.09 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  38.8 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  37.42 
 
 		 768 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  37.29 
 
 		 398 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  37.25 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  36.63 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  35.45 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.15 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  37.69 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.6 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  37.09 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 427 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.43 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.47 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.75 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.78 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.6 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.4 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  35.22 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.91 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 521 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.83 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.55 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.14 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  34.5 
 
 		 613 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  34.95 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  38.11 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  34.69 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  33.16 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.72 
 
 		 626 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.39 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.9 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.25 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2428  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.35 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.33496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.5 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.5 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.5 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  35.5 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  35.11 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  35.11 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  30.36 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  33.91 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.8 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.46 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.88 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.47 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  35.97 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  30.06 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.71 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.43 
 
 		 437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  31.63 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 466 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 466 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 466 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 466 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  32.69 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.62 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.54 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  31.72 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>