265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3582 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 476 aa  957    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  51.31 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  43.62 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.98 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.98 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  42.92 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.05 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  44.81 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  45.84 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.08 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  46.38 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 536 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 536 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.86 
 
 		 536 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  45.09 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.98 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  44.61 
 
 		 461 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  45.27 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  42.86 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.48 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  45.89 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  45.89 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  43.11 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  42.92 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.61 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  41.07 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.61 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.96 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.61 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.61 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  42.86 
 
 		 471 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  46.35 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  42.61 
 
 		 467 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  39.63 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  38.71 
 
 		 473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  42.89 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  38.82 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  38.73 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  38.73 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  39.16 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  41.67 
 
 		 472 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.14 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.68 
 
 		 468 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.18 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.36 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.77 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.89 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  38.01 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  37.88 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.77 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  38.32 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  38.32 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  39.41 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  38.07 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  39.16 
 
 		 540 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.16 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.16 
 
 		 540 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.16 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  37.65 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.16 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.16 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  38.32 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.64 
 
 		 543 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  38.4 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.42 
 
 		 474 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  37.82 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.39 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  37.56 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 		 390 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.84 
 
 		 353 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.73 
 
 		 196 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.22 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.85 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  33.43 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  32.68 
 
 		 419 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  27.81 
 
 		 393 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  34.12 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  30.29 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.61 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.1 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.27 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.46 
 
 		 768 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  31.54 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 330 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.8 
 
 		 311 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  29.53 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.04 
 
 		 336 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.36 
 
 		 626 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  41.21 
 
 		 220 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.05 
 
 		 594 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  29 
 
 		 348 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  30.12 
 
 		 343 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  27.29 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.66 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.16 
 
 		 626 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  28.9 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.77 
 
 		 357 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>