254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3754 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  94.07 
 
 		 473 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 		 536 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  76.65 
 
 		 540 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  93.43 
 
 		 473 aa  910    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.72 
 
 		 525 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  89.83 
 
 		 472 aa  824    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 		 536 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  94.07 
 
 		 473 aa  914    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 472 aa  962    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  94.07 
 
 		 473 aa  914    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  97.33 
 
 		 449 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.88 
 
 		 536 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 		 536 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  65.1 
 
 		 480 aa  614  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  63.19 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  56.07 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  51.74 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  48.28 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  44.84 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  47.94 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  47.94 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  48.23 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  47.98 
 
 		 467 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.98 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.98 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.98 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  47.73 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  48.2 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.8 
 
 		 374 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.82 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  45.16 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  47.22 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  47.4 
 
 		 461 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.73 
 
 		 462 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  47.14 
 
 		 469 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  47.03 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  46.52 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  46.02 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  46.25 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.15 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  46.25 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  42.01 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.43 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  41.56 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.95 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.9 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  37.25 
 
 		 491 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.21 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  38.37 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  38.81 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.78 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.96 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.96 
 
 		 540 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.37 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  39.1 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  37.05 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  37.13 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  36.64 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  37.13 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  36.7 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  37.31 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.78 
 
 		 474 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  35.78 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  33.65 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.19 
 
 		 196 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.47 
 
 		 353 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  30.33 
 
 		 378 aa  146  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  31.74 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  31.44 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  31.79 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  29.41 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.56 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  32.17 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.26 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 		 594 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  26.96 
 
 		 571 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  26.67 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.13 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.68 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.97 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.38 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 626 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 768 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  24.82 
 
 		 328 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.92 
 
 		 377 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.16 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  26.08 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.66 
 
 		 521 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  28.29 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  25.81 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>