271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1279 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  78.66 
 
 		 468 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  79.18 
 
 		 467 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.18 
 
 		 471 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  89.57 
 
 		 461 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  72.73 
 
 		 462 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  84.6 
 
 		 461 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  71.91 
 
 		 460 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  86.81 
 
 		 449 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  78.89 
 
 		 449 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.18 
 
 		 471 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 469 aa  963    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  86.81 
 
 		 449 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  81.36 
 
 		 435 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  78.92 
 
 		 471 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.18 
 
 		 471 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.78 
 
 		 374 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  71.78 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  60.11 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  53.01 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  59.4 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  59.4 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  58.82 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  54.09 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  52.42 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  49.74 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.97 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.75 
 
 		 525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.8 
 
 		 536 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  48.46 
 
 		 480 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.57 
 
 		 536 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.57 
 
 		 536 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.57 
 
 		 536 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.16 
 
 		 540 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  45.8 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  47.92 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  47.92 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  47.66 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  45.8 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  47.14 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  46.61 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.09 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.65 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  43.58 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  39.68 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.22 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.45 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  40.66 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  44.86 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  44.05 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  44.59 
 
 		 461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  44.59 
 
 		 461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  42.53 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  42.11 
 
 		 540 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.11 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.03 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  44.32 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  44.59 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  44.59 
 
 		 474 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.36 
 
 		 543 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  39.76 
 
 		 449 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  43.51 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  40 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.49 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  36.66 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  33.88 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  33.82 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50.28 
 
 		 196 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  33.88 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  31.55 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  29.95 
 
 		 419 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  33.42 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.02 
 
 		 357 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 377 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  27.94 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.25 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 		 311 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  28.65 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  28.28 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.3 
 
 		 626 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  29.31 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.9 
 
 		 345 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  29.24 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.32 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.9 
 
 		 351 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  29 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.38 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 338 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  30.61 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  31.16 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>