292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0994 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
626 aa  1285    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  45.33 
 
 
607 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  45.03 
 
 
616 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  41.04 
 
 
598 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  40.73 
 
 
594 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  42.94 
 
 
592 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  41.74 
 
 
594 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  36.48 
 
 
571 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  34.19 
 
 
613 aa  341  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  40.77 
 
 
431 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  29.36 
 
 
662 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  38.77 
 
 
768 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  43.13 
 
 
357 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.74 
 
 
336 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 
365 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  36.18 
 
 
384 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.57 
 
 
358 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  38.44 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 
521 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 
311 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  37.65 
 
 
626 aa  170  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  37.42 
 
 
348 aa  170  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  34.06 
 
 
346 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 
333 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.45 
 
 
431 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  37.08 
 
 
328 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  38.55 
 
 
314 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.33 
 
 
343 aa  164  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  36.27 
 
 
317 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  37.54 
 
 
343 aa  161  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.94 
 
 
353 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  36.54 
 
 
346 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  37.84 
 
 
459 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 
328 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.88 
 
 
332 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  36.09 
 
 
352 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  36.5 
 
 
332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  36 
 
 
360 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 
352 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  36.57 
 
 
322 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.33 
 
 
459 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.33 
 
 
459 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.33 
 
 
459 aa  154  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
379 aa  153  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  36.92 
 
 
464 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 
352 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.44 
 
 
335 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 
346 aa  152  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 
334 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.2 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 
302 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
346 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 
377 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.33 
 
 
365 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  35 
 
 
463 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 
331 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 
339 aa  144  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  35 
 
 
331 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.84 
 
 
369 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.56 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  34.77 
 
 
371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 
352 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  33.67 
 
 
333 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.99 
 
 
352 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  33 
 
 
465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  33 
 
 
465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  33 
 
 
465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 
333 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33 
 
 
465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 
342 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.67 
 
 
358 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.64 
 
 
365 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.67 
 
 
465 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
333 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  33.23 
 
 
377 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  31.9 
 
 
330 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  33.78 
 
 
333 aa  139  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 
330 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 
465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  35.98 
 
 
427 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.67 
 
 
465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.11 
 
 
346 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 
351 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 
333 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.22 
 
 
349 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  32.78 
 
 
345 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 
355 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  30.31 
 
 
340 aa  137  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 
466 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  31.67 
 
 
352 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.89 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.89 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  34.28 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.89 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
350 aa  135  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>