290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5805 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
571 aa  1182    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  51.63 
 
 
431 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  36.65 
 
 
626 aa  346  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  36.7 
 
 
594 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  36.22 
 
 
598 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  36.81 
 
 
594 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  36.02 
 
 
616 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  36.01 
 
 
592 aa  319  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  35.39 
 
 
613 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.07 
 
 
607 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  28.35 
 
 
662 aa  229  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 
768 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  35.71 
 
 
358 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.41 
 
 
357 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.35 
 
 
311 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.09 
 
 
343 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.9 
 
 
417 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.79 
 
 
365 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  34.46 
 
 
346 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
398 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 
337 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 
352 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  34.46 
 
 
365 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.42 
 
 
328 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 
352 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
352 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 
431 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 
427 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 
377 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.77 
 
 
302 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.36 
 
 
473 aa  140  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.59 
 
 
626 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 
330 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31.35 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  32.62 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 
369 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 
330 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 
521 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 
322 aa  134  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  32.18 
 
 
360 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  28.85 
 
 
304 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  29.25 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  35.98 
 
 
332 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
330 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 
335 aa  130  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  30.74 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  35.97 
 
 
332 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  29.39 
 
 
333 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 
330 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 
328 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  30.74 
 
 
344 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  31.35 
 
 
344 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  30.74 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  31.19 
 
 
459 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  31.19 
 
 
459 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  29.39 
 
 
333 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  30.74 
 
 
334 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  31.19 
 
 
459 aa  127  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  31.12 
 
 
398 aa  127  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.01 
 
 
384 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.05 
 
 
333 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 
398 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 
333 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  28.87 
 
 
409 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
314 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.31 
 
 
437 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 
348 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.51 
 
 
352 aa  124  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.18 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  32.25 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  28.91 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  31.47 
 
 
331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.73 
 
 
379 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.12 
 
 
416 aa  122  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.46 
 
 
343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  30.37 
 
 
377 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 
369 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  27 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  32.05 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.94 
 
 
361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  31.87 
 
 
339 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  29.67 
 
 
342 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  31.45 
 
 
365 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  27.39 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  29.64 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.43 
 
 
341 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  26.12 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.81 
 
 
351 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 
355 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.43 
 
 
341 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.6 
 
 
331 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.25 
 
 
367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  30.83 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  30.7 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>