271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1590 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 398 aa  826    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  50 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  48.32 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  46.8 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  48.6 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  46.81 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  44.66 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  45.43 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  38.62 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  38.51 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.75 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  39.26 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  34.7 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  37.63 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.9 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  38.98 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 		 357 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.71 
 
 		 343 aa  190  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.34 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  34.14 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  35.33 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.17 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.52 
 
 		 626 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  34.43 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  34.46 
 
 		 348 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 341 aa  166  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.42 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 594 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  34.43 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.04 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 613 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.63 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  31.5 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.5 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.22 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.07 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  33.74 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  33.23 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.18 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  33.84 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  35.74 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  32.46 
 
 		 592 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  32.98 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 		 768 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.64 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  34.84 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 		 521 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.53 
 
 		 365 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.74 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 		 626 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  32.63 
 
 		 311 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.72 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.04 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.93 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 607 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.13 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 377 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  29.13 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.25 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  34.51 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.21 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  30.46 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.22 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  32.75 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  32.75 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  31.07 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  33.82 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  30.49 
 
 		 616 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.5 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.48 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  32.53 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.8 
 
 		 346 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  33.21 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  31.56 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  32.97 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  32.72 
 
 		 333 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  30.75 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>