294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3489 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 368 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  54.62 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  54.46 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  52.23 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  48.91 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  48.77 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  52.08 
 
 		 352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  48.01 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  37.53 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  39 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  40.12 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  40.59 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  38.19 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.15 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 		 353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  35.76 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  39.41 
 
 		 311 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.53 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  37.39 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.97 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  34.32 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  34.41 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.55 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  33.14 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  37.07 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.2 
 
 		 768 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  36.71 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  35.91 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35.25 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  36.46 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  36.77 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  31.74 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  33.04 
 
 		 626 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  35.02 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  35.56 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.78 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.9 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.51 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  33.89 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.4 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  34.67 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.86 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.23 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.09 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  34.55 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.91 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.85 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  33.11 
 
 		 308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.15 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  35.66 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.51 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.51 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.51 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.91 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.15 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  31.52 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  33.93 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.11 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.24 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.11 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.66 
 
 		 346 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  33.78 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  33.78 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  33.78 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  30.85 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  33.66 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.89 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 328 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  33.81 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  34.01 
 
 		 466 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 463 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  34.8 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>