More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1600 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 357 aa  733    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  49.3 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  48.49 
 
 		 336 aa  269  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  45.09 
 
 		 626 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  48.45 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  46.84 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  42.51 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  41.96 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  44.44 
 
 		 431 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  43.19 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  42.27 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  39.33 
 
 		 360 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  42.43 
 
 		 348 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  42.54 
 
 		 768 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  37.63 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  41.23 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  41.46 
 
 		 401 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  43.93 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  40.24 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  40.67 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  39.48 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  41.07 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  37.82 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  40.68 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 521 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  40.13 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  40.37 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  39.87 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  42.39 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  41.53 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  37.7 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  37.28 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  40.13 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  36.39 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  40.13 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  40.62 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  37.34 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  38.41 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  38.41 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  42.81 
 
 		 626 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  37.91 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  38.41 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  36.92 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  37.75 
 
 		 594 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  37.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  37.95 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  37.91 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  41.21 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  38.14 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.76 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  39.81 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  39.3 
 
 		 335 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  38.51 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  39.02 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  37.58 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  37.71 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  38.19 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  37.74 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  37.33 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  37.54 
 
 		 342 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  37.62 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  37.3 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.6 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  38.91 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  34.13 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  38.28 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  38.54 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  36.65 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  37.1 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  36.77 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  39.62 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  38.39 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  36.98 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.06 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  36.98 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  36.98 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  38.59 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 		 598 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  36.98 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  36.67 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  36.89 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  36.48 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  33.75 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  36.45 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  35.06 
 
 		 613 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  38.61 
 
 		 463 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  37.34 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  37.09 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  34.52 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  38.54 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  36.07 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>