283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3631 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 390 aa  785    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  74.49 
 
 		 365 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  43.12 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  40.94 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  38.64 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  38.72 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  38.62 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  38.07 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  41.23 
 
 		 399 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  39.09 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  41.21 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.04 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  39.63 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  33.33 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  36.72 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.95 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  37.42 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.83 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  34.49 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 		 594 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 		 768 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  32.42 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  36.06 
 
 		 521 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.76 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.51 
 
 		 626 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.1 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  36.66 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  33.11 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.88 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.11 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.64 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.13 
 
 		 613 aa  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.75 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.8 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  36.18 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.79 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  36.45 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  31.07 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.21 
 
 		 373 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  34.12 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.38 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  32.48 
 
 		 345 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.53 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  31.21 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.63 
 
 		 333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  30.53 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.34 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  29.34 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  31.85 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  29.91 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  31.07 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.08 
 
 		 626 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  32.3 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.79 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.11 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  30.31 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  29.72 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  29.41 
 
 		 333 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  29.49 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  32.25 
 
 		 571 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  29.01 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  32.03 
 
 		 607 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  32.47 
 
 		 616 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  29.1 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.32 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  29.1 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  28.66 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.11 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  29.02 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.29 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  30.63 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  30.63 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  29.56 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  33.95 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>