291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0900 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 
337 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  58.66 
 
 
328 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  51.44 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  48.01 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  46.11 
 
 
353 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  46.25 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  43.73 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  43.73 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  44.1 
 
 
352 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.68 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  40.43 
 
 
336 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40.13 
 
 
357 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  37.25 
 
 
346 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.22 
 
 
626 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 
521 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 
379 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  38.41 
 
 
334 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.96 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  36.97 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.79 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 
768 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.95 
 
 
349 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  37.06 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  35.69 
 
 
346 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  36.13 
 
 
343 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.57 
 
 
358 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 
369 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 
384 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  34.87 
 
 
322 aa  175  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  34.96 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 
345 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.19 
 
 
346 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 
365 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  36.76 
 
 
342 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  34.98 
 
 
351 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  37.2 
 
 
431 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.98 
 
 
346 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  34.91 
 
 
352 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.6 
 
 
377 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  35.53 
 
 
352 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  36.51 
 
 
355 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  34.12 
 
 
339 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.31 
 
 
345 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  34.9 
 
 
384 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 
330 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.21 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  36.68 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  34.35 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  31.66 
 
 
365 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.38 
 
 
367 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 
398 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.92 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33.89 
 
 
459 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33.89 
 
 
459 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  34.55 
 
 
331 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33.89 
 
 
459 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.32 
 
 
333 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  32.6 
 
 
377 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  31.42 
 
 
365 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  35.02 
 
 
340 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  35 
 
 
346 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  34.15 
 
 
348 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.69 
 
 
345 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  32.49 
 
 
427 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  34.92 
 
 
347 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 
348 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 
352 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  31.56 
 
 
383 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  34.97 
 
 
465 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.97 
 
 
465 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.92 
 
 
333 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.97 
 
 
465 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  34.92 
 
 
347 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
344 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
344 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
344 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  31.87 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  31.54 
 
 
613 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.97 
 
 
465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 
344 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  34.64 
 
 
465 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  34.64 
 
 
465 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  34.64 
 
 
465 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  35.86 
 
 
333 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 
373 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  32.5 
 
 
592 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  34.14 
 
 
353 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 
333 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 
333 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  33.45 
 
 
473 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.58 
 
 
333 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33.9 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  34.69 
 
 
341 aa  152  8e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  34.35 
 
 
341 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 
345 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 
459 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 
571 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>