288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1545 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 384 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  40 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  38.11 
 
 		 768 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.24 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  35.14 
 
 		 328 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  34.6 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  35.92 
 
 		 626 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.82 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  33.99 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  34.63 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  36.48 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.16 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  33.82 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.22 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.73 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  33.71 
 
 		 594 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  34.4 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  35 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.86 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.42 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  33.52 
 
 		 521 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 		 607 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  34.18 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.66 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  34.82 
 
 		 359 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 		 592 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.87 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  34.81 
 
 		 616 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  33.02 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  32.99 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  32.71 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.62 
 
 		 358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.33 
 
 		 346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  33.96 
 
 		 346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  31.9 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  34.29 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  30.4 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.22 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  30.88 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  31.07 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  31.07 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 598 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.07 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  30.79 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.35 
 
 		 626 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  30.23 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.12 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.79 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  30 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  34.14 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.18 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  30.06 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.04 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 594 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  30.9 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  30.67 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  30.6 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.22 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  30.37 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  29.88 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  31.02 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  31.89 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  35.11 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.39 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.41 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  30.28 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  33.54 
 
 		 330 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  29.83 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.33 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  29.34 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  30.45 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  30.45 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  28.95 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  30.45 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  28.33 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>