267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1860 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 358 aa  739    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.91 
 
 		 768 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.12 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.53 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.15 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  32.41 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.37 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.89 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  33.63 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.74 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.87 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  32.92 
 
 		 473 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  35.85 
 
 		 521 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  33.02 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.62 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  31.12 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.42 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  29.97 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  30.84 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  34.75 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.94 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.59 
 
 		 437 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.63 
 
 		 346 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.06 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  33.94 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.72 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  29.3 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  32.37 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  32.24 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.71 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.12 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  32.65 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  30.73 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.35 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  33.78 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  31.02 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.44 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.44 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  33.44 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  33.44 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  31.21 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.44 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  31.7 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.06 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  30.65 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  30.46 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  31.45 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  32.36 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  31.77 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  28.65 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 431 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  30.65 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.9 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.07 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  30.72 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  29.65 
 
 		 306 aa  133  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  31.37 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  28.8 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  29.84 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  29.7 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.3 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  31.37 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  30.58 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 594 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  31.78 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  29.52 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>