More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3135 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 302 aa  631  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  48.68 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  48.01 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  45.21 
 
 		 358 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  46.73 
 
 		 353 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  41.91 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  43.43 
 
 		 352 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 346 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  42.27 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  41.96 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  36.79 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  39.38 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.48 
 
 		 369 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.46 
 
 		 379 aa  195  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  37.93 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  38.41 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  35.79 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  36.03 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.95 
 
 		 626 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.15 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.59 
 
 		 521 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  34.71 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 		 768 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.71 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  34.69 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  33.68 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.36 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  32.67 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.66 
 
 		 365 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 		 431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.21 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.54 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  32.32 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  32.9 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.65 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 377 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  34.01 
 
 		 459 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  34.01 
 
 		 459 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  34.01 
 
 		 459 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.01 
 
 		 473 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.22 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.89 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  33.67 
 
 		 613 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 463 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  30.74 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.77 
 
 		 365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  31.39 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.85 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  31.82 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  31.92 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.17 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  32.44 
 
 		 459 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  35.54 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.77 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  31.42 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 466 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  30.7 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  32.25 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 466 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 466 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 466 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  29.8 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 466 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.89 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.8 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.88 
 
 		 465 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  31.65 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  31.88 
 
 		 465 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  31.72 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  31.82 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1108  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase; CCP)  29.79 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0173409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 598 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>