296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1107 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 417 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  44.86 
 
 		 768 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.39 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  40.06 
 
 		 626 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  35.24 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  37.29 
 
 		 594 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  37.94 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  32.96 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  35.6 
 
 		 592 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  40.56 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  35.74 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 		 431 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  39.25 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  37.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  37.02 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  37.58 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 		 328 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  36.21 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  32.78 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  37.59 
 
 		 616 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  36.39 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  34.85 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  35.08 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  39.6 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  36.67 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  35.67 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  36.52 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  34.09 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  35.86 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  34.87 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  35.18 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.21 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  33.63 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 353 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  36.16 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  37.75 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  34.19 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  34.19 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  38.02 
 
 		 352 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  36.33 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.35 
 
 		 626 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  34.53 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33.78 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  36.95 
 
 		 339 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  34.67 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  33.99 
 
 		 335 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.88 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  34.73 
 
 		 607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  34.75 
 
 		 333 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  34.9 
 
 		 571 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  34.02 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  34.36 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  34.24 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  35.22 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  33.33 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  35.59 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 		 330 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  34.63 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.53 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  33.68 
 
 		 304 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.68 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  35.63 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  32.78 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  37.2 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  33.76 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  33.53 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  32.68 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  34.31 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  34.31 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  33.76 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  33.67 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  35.16 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  31.68 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  33.67 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  34.44 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  35.31 
 
 		 359 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  33.54 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 314 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  35.55 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>