More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04430 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 359 aa  744    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  56.11 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  58.72 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  53.16 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  48.01 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  45.31 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  45.99 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  46.98 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  41.25 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  39.34 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  39.88 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  38.26 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  36.8 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  38.31 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  34.43 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  36.43 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.97 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.57 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.45 
 
 		 768 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.19 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  31.39 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  32.58 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.01 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.54 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  35.07 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  32.99 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  31.62 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  32.84 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.25 
 
 		 626 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  33.14 
 
 		 398 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  34.11 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  29.63 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  32.78 
 
 		 613 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.53 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.64 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  32.23 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  32.38 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  34.04 
 
 		 464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  34.02 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  32.12 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  32.16 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.41 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  33.45 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  32.13 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.3 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  30.98 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.94 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.46 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  32.74 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  30.38 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  32.76 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  32.76 
 
 		 459 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.9 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.02 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.6 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.3 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  31.6 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  33.8 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  32.62 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  35.59 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  35.59 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.33 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.59 
 
 		 465 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  27.52 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.15 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  35.59 
 
 		 465 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.59 
 
 		 465 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.24 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  31.45 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.22 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.93 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  28.52 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  33.1 
 
 		 384 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  29.83 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.66 
 
 		 473 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  26.99 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  30.93 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  30.6 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  32.64 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  28.36 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  30.53 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  32.87 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>