278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1998 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 352 aa  740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  52.08 
 
 		 368 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  46.15 
 
 		 345 aa  322  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  44.83 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  44.83 
 
 		 341 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  46.98 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  45.03 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  44.74 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  36.69 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  38.92 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  35.82 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  33.88 
 
 		 377 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  34.8 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.13 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.17 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.21 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.56 
 
 		 626 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.17 
 
 		 768 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  34.65 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  33.89 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.63 
 
 		 417 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.02 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.39 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.73 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  33.89 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  31 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.72 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2428  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.12 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.33496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.68 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  31.13 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  33.89 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  32.67 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  31.17 
 
 		 308 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  33.06 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  27.86 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  28.67 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  31.86 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  30.58 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  26.3 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  32.27 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  29.61 
 
 		 613 aa  129  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  27.73 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  29.48 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  27.55 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 		 521 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  28.87 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.58 
 
 		 398 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  31.4 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.04 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.23 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  28.88 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  31.44 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  29.89 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  28.3 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  31.29 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  32.51 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.34 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.22 
 
 		 473 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  29.23 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.5 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  29.86 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  28.98 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  32.5 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.68 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  29.68 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  27.9 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  32.5 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  32.5 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  29.33 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.5 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  32.5 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.82 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.5 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.33 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  30.18 
 
 		 459 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  30.18 
 
 		 459 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>