264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4206 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  79.02 
 
 		 441 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 463 aa  951    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 463 aa  951    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  66.82 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  56.46 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  61.08 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  58.93 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  56.52 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  58.47 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  58.2 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  58.2 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  58.2 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  58.56 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  58.2 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  57.94 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  55.14 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  55.92 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  57.92 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  57.45 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  57.75 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  55.78 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  55.78 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  54.1 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  54.52 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  53.26 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.13 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.64 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.64 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.88 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.64 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.16 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  47.75 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  46.52 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  48.2 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  47.21 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  47.94 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.94 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  43.28 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.59 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.12 
 
 		 451 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  42.23 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.24 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  35.71 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.93 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.32 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.21 
 
 		 540 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  40.43 
 
 		 540 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.21 
 
 		 543 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  40.16 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  40.16 
 
 		 448 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  39.74 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  37.25 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  37.25 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 		 465 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  39.78 
 
 		 446 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.43 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  40.43 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  39.78 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.98 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  38.34 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  50 
 
 		 196 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  32.61 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  31.78 
 
 		 378 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  30.81 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  32.84 
 
 		 422 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  33.76 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  31.52 
 
 		 393 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.29 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.32 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 302 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  28.62 
 
 		 431 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  29.82 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.47 
 
 		 768 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.65 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  27.06 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 626 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  24.54 
 
 		 613 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.04 
 
 		 616 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  27.16 
 
 		 417 aa  94  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  24.8 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  30.61 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  25.11 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  24.52 
 
 		 594 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  30.27 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  28.43 
 
 		 449 aa  91.3  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.82 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.69 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>