263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0723 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 451 aa  894    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  59.17 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  55.58 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  55.58 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  55.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  56.34 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  54.61 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  55.37 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.65 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  54.15 
 
 		 472 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.65 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.76 
 
 		 536 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.65 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.1 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  53.06 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  51.23 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  51.12 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  44.6 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.82 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  45.27 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  45.34 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.39 
 
 		 460 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  45.08 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  45.34 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.08 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.08 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.08 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.43 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  43.41 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.34 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  44.13 
 
 		 461 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  44.39 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  44.3 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  44.04 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  44.04 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  44.04 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  43.67 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  43.6 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.61 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.61 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.75 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.24 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.16 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.8 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.96 
 
 		 413 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  41.31 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  40.83 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  40.05 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  40.81 
 
 		 461 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  40.81 
 
 		 461 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  39.53 
 
 		 446 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.18 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.53 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  39.8 
 
 		 458 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  40.3 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  40.95 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  38.1 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.33 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  39.69 
 
 		 456 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.69 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.33 
 
 		 540 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.1 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.1 
 
 		 543 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  33.74 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  32.68 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.3 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.63 
 
 		 196 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.17 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  32.6 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  28.64 
 
 		 393 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 361 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  31.06 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.19 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  27.78 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.18 
 
 		 346 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  28.43 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  24.04 
 
 		 594 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  26.43 
 
 		 353 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.98 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  27.66 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  28.75 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  26.96 
 
 		 304 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  26.85 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.87 
 
 		 369 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  25.97 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  27.51 
 
 		 333 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 311 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  27.27 
 
 		 304 aa  93.6  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.68 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.97 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  28.17 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  26.63 
 
 		 331 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.89 
 
 		 328 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  25.27 
 
 		 336 aa  90.1  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>