254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4344 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 
536 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  76.65 
 
 
540 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 
536 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  94.08 
 
 
473 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.38 
 
 
525 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  89.83 
 
 
472 aa  826    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
473 aa  965    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  93.32 
 
 
449 aa  841    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  94.07 
 
 
472 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
473 aa  965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.83 
 
 
536 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  98.31 
 
 
473 aa  955    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.1 
 
 
536 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  65.46 
 
 
480 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  63.42 
 
 
480 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  55.58 
 
 
451 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  51 
 
 
454 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  48.66 
 
 
455 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  44.92 
 
 
428 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 
463 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 
463 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  49.12 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  48.87 
 
 
467 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.87 
 
 
471 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.87 
 
 
471 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.87 
 
 
471 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  48.71 
 
 
441 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  48.61 
 
 
468 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.71 
 
 
374 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.03 
 
 
460 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  48.35 
 
 
461 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  47.22 
 
 
461 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.96 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  47.92 
 
 
469 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  47.68 
 
 
461 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.61 
 
 
462 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  47.28 
 
 
449 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  47.28 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  47.28 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  47.38 
 
 
435 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.3 
 
 
433 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  41.77 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.04 
 
 
476 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  41.81 
 
 
454 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.68 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.64 
 
 
413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  37.83 
 
 
491 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.11 
 
 
543 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.86 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  38.86 
 
 
540 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.47 
 
 
433 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  38.15 
 
 
458 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  38.35 
 
 
448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  37.28 
 
 
446 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  38.1 
 
 
448 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  38.4 
 
 
436 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  38.65 
 
 
461 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  38.65 
 
 
461 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.28 
 
 
446 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  38.6 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  35.62 
 
 
449 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.09 
 
 
474 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  37.09 
 
 
456 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  33.82 
 
 
390 aa  196  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.37 
 
 
196 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.81 
 
 
353 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 
378 aa  146  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  31.98 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  31.85 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  29.38 
 
 
361 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.71 
 
 
419 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  33.68 
 
 
393 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.4 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  28.5 
 
 
431 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  25.38 
 
 
594 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.6 
 
 
431 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.19 
 
 
379 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  27.48 
 
 
453 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  29.5 
 
 
361 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.11 
 
 
487 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.84 
 
 
626 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  27.11 
 
 
571 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  24.44 
 
 
613 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  26.8 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.55 
 
 
336 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.73 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  27.59 
 
 
357 aa  97.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 
311 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.16 
 
 
768 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.71 
 
 
369 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  29.63 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  24.75 
 
 
328 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 
616 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  26.88 
 
 
384 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  28.98 
 
 
331 aa  94  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>