288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4466 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
427 aa  870    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  67.51 
 
 
424 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  47.8 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.92 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.26 
 
 
440 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.68 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4030  beta strand repeat-containing protein  40.26 
 
 
261 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.66 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.81 
 
 
346 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  32.32 
 
 
336 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  30.71 
 
 
398 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  27.02 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  31.84 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.79 
 
 
594 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.51 
 
 
431 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  28.2 
 
 
358 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.26 
 
 
337 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.31 
 
 
353 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 
330 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.3 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  30.65 
 
 
768 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 
521 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 
302 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.01 
 
 
334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
377 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.89 
 
 
333 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  26.38 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 
598 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 
417 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.05 
 
 
613 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.16 
 
 
594 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  27.42 
 
 
342 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  28.69 
 
 
365 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 
348 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  26.6 
 
 
365 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  26.57 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 
365 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  29.57 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  29.89 
 
 
571 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  27.25 
 
 
358 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  27.15 
 
 
339 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 
384 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  28.04 
 
 
322 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  28.73 
 
 
328 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.28 
 
 
346 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  26.98 
 
 
341 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  26.98 
 
 
341 aa  106  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  30.26 
 
 
383 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 
473 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  26.96 
 
 
350 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.21 
 
 
346 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  28.05 
 
 
347 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  26.1 
 
 
384 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  26.61 
 
 
345 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  25.78 
 
 
352 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 
401 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  28.3 
 
 
397 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  26.34 
 
 
353 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  28.45 
 
 
347 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.73 
 
 
626 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  27.78 
 
 
331 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  27.25 
 
 
345 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  27.01 
 
 
346 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  28.87 
 
 
472 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  30.91 
 
 
343 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  29.78 
 
 
390 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  25.58 
 
 
346 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  26.54 
 
 
346 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  28.65 
 
 
346 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 
347 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  25.06 
 
 
349 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  27.81 
 
 
347 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  27.03 
 
 
371 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  27.58 
 
 
345 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  30.37 
 
 
399 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  28.34 
 
 
468 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  29.94 
 
 
332 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.15 
 
 
361 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 
616 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  25.35 
 
 
344 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  26.32 
 
 
333 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  26.89 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 
338 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  23.44 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  26.37 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  26.8 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  29.94 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  26.8 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  23.56 
 
 
304 aa  98.2  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  28.6 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  25.35 
 
 
344 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  25.35 
 
 
344 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  25.21 
 
 
333 aa  97.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  25.63 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  24.93 
 
 
333 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  29.41 
 
 
330 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>