178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4030 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4030  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  40.26 
 
 
427 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.8 
 
 
416 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  39.74 
 
 
424 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  36.94 
 
 
409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.06 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.88 
 
 
336 aa  78.6  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  32.39 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.17 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.27 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  30.81 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  30.7 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  30.7 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.77 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  39.62 
 
 
343 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.06 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  30.23 
 
 
333 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 
344 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  29.36 
 
 
521 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  36.11 
 
 
348 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  27.44 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  28.51 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  38.1 
 
 
417 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  29.86 
 
 
347 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  26.52 
 
 
346 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  36.44 
 
 
347 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 
352 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.91 
 
 
431 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  28.1 
 
 
330 aa  59.3  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.7 
 
 
346 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  31.36 
 
 
377 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 
346 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 
334 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.69 
 
 
352 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  26.89 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  25.69 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  28.07 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  28 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  32.98 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  29.3 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  27.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  28.64 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  29.13 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.58 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  37.76 
 
 
350 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 
371 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  38.38 
 
 
360 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.65 
 
 
626 aa  55.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  27.63 
 
 
345 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  36.96 
 
 
346 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  35.65 
 
 
401 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.05 
 
 
352 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  31.02 
 
 
464 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.17 
 
 
598 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  28.78 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  37.96 
 
 
338 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  28.92 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  32.08 
 
 
335 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.77 
 
 
377 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  25.36 
 
 
304 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  30.47 
 
 
339 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  33.03 
 
 
328 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  36.17 
 
 
355 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  39.33 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  24.76 
 
 
613 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  25.84 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.61 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  36.29 
 
 
459 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  28.64 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  28.37 
 
 
340 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  28.63 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.59 
 
 
626 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  37.11 
 
 
351 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  39.29 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  40.7 
 
 
459 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  40.7 
 
 
459 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  40.7 
 
 
459 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  24.88 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2428  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.08 
 
 
358 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.33496 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  33.33 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  33.68 
 
 
333 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  30.16 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  34.91 
 
 
349 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  26.24 
 
 
592 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.15 
 
 
446 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  32.56 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>