259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4214 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  96.04 
 
 
448 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  89.59 
 
 
456 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  80.24 
 
 
540 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  99.08 
 
 
436 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.24 
 
 
540 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.24 
 
 
540 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  89.35 
 
 
474 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  90.97 
 
 
465 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  92.94 
 
 
458 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  79.95 
 
 
543 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  78.92 
 
 
433 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
461 aa  922    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  95.54 
 
 
448 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
461 aa  922    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.24 
 
 
540 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.24 
 
 
540 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  80 
 
 
540 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  80.24 
 
 
540 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  69.1 
 
 
449 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  70 
 
 
446 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  69.74 
 
 
446 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  91.22 
 
 
220 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  90.11 
 
 
196 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.47 
 
 
429 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  44.62 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  44.16 
 
 
469 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  41.55 
 
 
441 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  41.75 
 
 
468 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 
463 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.32 
 
 
463 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  41.18 
 
 
471 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  40.93 
 
 
467 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.93 
 
 
471 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.93 
 
 
471 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.93 
 
 
471 aa  256  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.71 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  36.99 
 
 
460 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  38.86 
 
 
455 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.37 
 
 
433 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  43.94 
 
 
461 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  40.35 
 
 
424 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  40.52 
 
 
461 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.92 
 
 
525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  36.9 
 
 
472 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  36.57 
 
 
449 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  41.89 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  41.78 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  41.78 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  36.55 
 
 
472 aa  239  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
480 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  40.64 
 
 
435 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.93 
 
 
536 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.93 
 
 
536 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  39.1 
 
 
473 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.68 
 
 
462 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.93 
 
 
536 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.93 
 
 
536 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  39.1 
 
 
473 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  39.1 
 
 
473 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.56 
 
 
540 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.56 
 
 
480 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  37.5 
 
 
473 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.71 
 
 
476 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.7 
 
 
413 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  37.41 
 
 
468 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  37.92 
 
 
454 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  44.13 
 
 
454 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.81 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  34.97 
 
 
491 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  36.97 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  35.01 
 
 
390 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  34.78 
 
 
353 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  34.81 
 
 
361 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  35.81 
 
 
422 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  35.62 
 
 
378 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  34.9 
 
 
387 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  31.85 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  30.84 
 
 
451 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.7 
 
 
357 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  30.81 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  30.68 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.14 
 
 
311 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  29.03 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.89 
 
 
626 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.99 
 
 
594 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  27.67 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.5 
 
 
613 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
346 aa  97.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  25.95 
 
 
343 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  25.73 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.04 
 
 
487 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  29.7 
 
 
345 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.75 
 
 
379 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 
768 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.75 
 
 
369 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  29.49 
 
 
368 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  26.43 
 
 
328 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  28.76 
 
 
336 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.9 
 
 
594 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>