252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5017 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  70.68 
 
 
480 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
480 aa  996    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  63.85 
 
 
473 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  63.85 
 
 
473 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  63.42 
 
 
473 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  63.41 
 
 
473 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  67.61 
 
 
525 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  63.64 
 
 
472 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  64.45 
 
 
536 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  63.23 
 
 
449 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  61.75 
 
 
472 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  65.4 
 
 
536 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  65.4 
 
 
536 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  65.4 
 
 
536 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  62.82 
 
 
540 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  51.23 
 
 
451 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  50.25 
 
 
454 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  47.96 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  45.84 
 
 
471 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  45.59 
 
 
467 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  47.19 
 
 
460 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  45.16 
 
 
463 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.16 
 
 
463 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  47.58 
 
 
449 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  45.59 
 
 
468 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.59 
 
 
471 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.59 
 
 
471 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.59 
 
 
471 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  46.29 
 
 
374 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  47.58 
 
 
449 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  47.58 
 
 
449 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  44.36 
 
 
428 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  46.94 
 
 
469 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  47.19 
 
 
435 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  46.17 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  45.92 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  41.39 
 
 
429 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  43.18 
 
 
441 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  45.78 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  38.23 
 
 
455 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  43.77 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  42.6 
 
 
424 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.81 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  38.93 
 
 
468 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  36.72 
 
 
491 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.75 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  37.71 
 
 
454 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  35.01 
 
 
436 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.9 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  35.9 
 
 
540 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  35.23 
 
 
461 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  35.23 
 
 
461 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  36.41 
 
 
446 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  35.41 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.41 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  34.71 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.16 
 
 
543 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  34.65 
 
 
448 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  34.88 
 
 
465 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  34.65 
 
 
458 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.88 
 
 
433 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.09 
 
 
474 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  35.09 
 
 
456 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  34.67 
 
 
390 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  30.56 
 
 
361 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  30.14 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  32.11 
 
 
422 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  31.28 
 
 
419 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.78 
 
 
196 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  29.48 
 
 
378 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  30.06 
 
 
453 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.15 
 
 
451 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.85 
 
 
594 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.86 
 
 
487 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.82 
 
 
393 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  27.09 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  27.11 
 
 
613 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  28.32 
 
 
387 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  29.38 
 
 
598 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 
626 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.73 
 
 
431 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.98 
 
 
369 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.96 
 
 
379 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 
594 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  25.56 
 
 
357 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  25.97 
 
 
346 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  25.52 
 
 
768 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  25.07 
 
 
592 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  24.48 
 
 
417 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.66 
 
 
616 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  23.73 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  25.84 
 
 
337 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  26.57 
 
 
371 aa  90.1  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  29.69 
 
 
341 aa  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  25.46 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>