212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0921 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
474 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
456 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  91.22 
 
 
436 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  91.22 
 
 
461 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  91.22 
 
 
461 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  90.73 
 
 
465 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  88.78 
 
 
458 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  89.27 
 
 
448 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  88.78 
 
 
448 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.54 
 
 
543 aa  322  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  78.11 
 
 
540 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  78.11 
 
 
540 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  74.42 
 
 
540 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.61 
 
 
540 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.61 
 
 
540 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.61 
 
 
540 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.61 
 
 
540 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  73.66 
 
 
433 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  67.42 
 
 
449 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  63.48 
 
 
446 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  62.92 
 
 
446 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  37.85 
 
 
429 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  36.42 
 
 
491 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  39.77 
 
 
461 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  31.72 
 
 
353 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  34.52 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  39.18 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  36.76 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  36.22 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  36.22 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
441 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.22 
 
 
471 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.22 
 
 
471 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.22 
 
 
471 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.1 
 
 
374 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  35 
 
 
433 aa  81.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.21 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  38.52 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  34.76 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  38.24 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.95 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.95 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.93 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  34.68 
 
 
525 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.32 
 
 
468 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  36.7 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  33.76 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.89 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.16 
 
 
626 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  35.66 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  35.09 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.6 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.94 
 
 
460 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40 
 
 
462 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
435 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  35.12 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  32.3 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 
536 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 
536 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 
536 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  33.33 
 
 
536 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.6 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  27.39 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.16 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  29.03 
 
 
613 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  34.71 
 
 
387 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.05 
 
 
451 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  31.28 
 
 
480 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.66 
 
 
451 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  36.62 
 
 
357 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  27.78 
 
 
472 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 
328 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 
379 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  36.3 
 
 
428 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.3 
 
 
393 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
473 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  35.4 
 
 
311 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  27.35 
 
 
449 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 
473 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 
473 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  30.1 
 
 
473 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.11 
 
 
768 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  31.29 
 
 
337 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  32.14 
 
 
419 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  32.37 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
348 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.99 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  33.59 
 
 
440 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  35.34 
 
 
453 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 
398 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
521 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
346 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  35.37 
 
 
367 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  34.19 
 
 
346 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  28.47 
 
 
369 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>