66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1461 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  100 
 
 		 418 aa  844    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  51.82 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  43.28 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  42.82 
 
 		 460 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  44.27 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  44.27 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  44.37 
 
 		 475 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  44.5 
 
 		 473 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  43.89 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  44.04 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  43.37 
 
 		 475 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  42.63 
 
 		 462 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  44.98 
 
 		 471 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  42.47 
 
 		 475 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  42.02 
 
 		 475 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  42.66 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  41.35 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  43.08 
 
 		 470 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  42.92 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  44.9 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  43.76 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  43.05 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  42.15 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  41.69 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  41.91 
 
 		 501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  40.8 
 
 		 510 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  41.1 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  40.66 
 
 		 502 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  39.91 
 
 		 512 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  38 
 
 		 548 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  40.66 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  37.58 
 
 		 543 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  40.13 
 
 		 517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  37.55 
 
 		 551 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  40.27 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  41.05 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  36.64 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  40.04 
 
 		 492 aa  278  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  38.44 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  36.82 
 
 		 541 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  36.82 
 
 		 541 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  38.22 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  36.14 
 
 		 542 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  35.47 
 
 		 541 aa  272  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  36.73 
 
 		 549 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.36 
 
 		 512 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  35.83 
 
 		 539 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  35.85 
 
 		 491 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 538 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  35.56 
 
 		 560 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  35.78 
 
 		 562 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  40.99 
 
 		 879 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  37.56 
 
 		 528 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  41.22 
 
 		 1028 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  38.72 
 
 		 970 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.73 
 
 		 1707 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  37.38 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  37.82 
 
 		 737 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  29.31 
 
 		 472 aa  162  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  38.93 
 
 		 794 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  27.87 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  25.35 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  39.33 
 
 		 106 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  24.5 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  53.66 
 
 		 41 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>