61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3543 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  100 
 
 		 519 aa  1063    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  25.31 
 
 		 564 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  26.44 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  26.44 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  26.78 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  25.68 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  25.76 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.54 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  25.82 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  27.05 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  26.53 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  24.08 
 
 		 1707 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  25.42 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  26.83 
 
 		 510 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  24.07 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  27.18 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  24.54 
 
 		 1028 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  25.68 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  26.77 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  26.67 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  26.67 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  26.34 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  23.9 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  25.35 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  28.17 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  25.59 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  24.89 
 
 		 970 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  25.71 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  27.04 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  25.14 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  24.75 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  23.21 
 
 		 879 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  25.23 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  26.67 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  24.5 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  23.9 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  25.6 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  26.17 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  27.46 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  24.55 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  25.23 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  26.76 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  25.14 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  27.32 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  39.56 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  24.27 
 
 		 460 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  23.32 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  24.64 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  24.27 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  25.4 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  25.65 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  24.41 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  28.24 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  24.64 
 
 		 560 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  25.12 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  24.64 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  26.59 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  32.61 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  23 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>