65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3528 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1048    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  65.5 
 
 		 512 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  67 
 
 		 512 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  59.96 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  59 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  54.09 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  53.77 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  53.67 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  53.59 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  54.64 
 
 		 510 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  52.14 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  51.42 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  51.64 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  51.64 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  50.33 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  49.89 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  51.1 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  51.54 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  49.89 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  50.98 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  49.45 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  46 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  50.65 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  45.37 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  43.42 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  43.75 
 
 		 462 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  45.13 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  44.66 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  41.59 
 
 		 541 aa  350  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  43.6 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  45.68 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  42.86 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  42.43 
 
 		 503 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  41.9 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  40.36 
 
 		 562 aa  332  9e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  40.37 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  42.83 
 
 		 480 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  40.52 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  43.15 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  40.67 
 
 		 456 aa  299  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  39.91 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  38.44 
 
 		 418 aa  277  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  40.74 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  36.57 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  37.42 
 
 		 879 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  36.06 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  34.5 
 
 		 543 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  36.07 
 
 		 541 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  36 
 
 		 551 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  36.51 
 
 		 549 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  35.47 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  35.7 
 
 		 539 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  38.38 
 
 		 970 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  35.17 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.3 
 
 		 1707 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  35.32 
 
 		 1028 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  39.67 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  37.23 
 
 		 737 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  36.42 
 
 		 794 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  27.11 
 
 		 472 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  26.83 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  26.77 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  42.17 
 
 		 106 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  24.75 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  51.22 
 
 		 41 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>