70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0672 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  66.16 
 
 		 538 aa  697    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  78.23 
 
 		 543 aa  858    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  77.32 
 
 		 541 aa  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  80.57 
 
 		 539 aa  887    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  80.19 
 
 		 542 aa  874    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  83.05 
 
 		 549 aa  906    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1137    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  76.77 
 
 		 541 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  75.59 
 
 		 548 aa  847    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  41.5 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  40.62 
 
 		 480 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  40.24 
 
 		 469 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  39.03 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  37.83 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  38.91 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  39.04 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  38.96 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  38.59 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  37.15 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  37.1 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  38.6 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  37.63 
 
 		 443 aa  297  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  39.68 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  36.81 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  36.67 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  38.31 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  37.4 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  39.44 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  37.83 
 
 		 502 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  40.29 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  37.32 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  37.55 
 
 		 418 aa  286  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  37.62 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  37.02 
 
 		 502 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  37.9 
 
 		 510 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  37.37 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  35.95 
 
 		 541 aa  280  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  36.69 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  38.43 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  37.65 
 
 		 503 aa  276  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  37.22 
 
 		 512 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  39.34 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  35.03 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  38.31 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  36.23 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  35.4 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  36.06 
 
 		 562 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  36 
 
 		 517 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  38.16 
 
 		 471 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  35.01 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  34.89 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  34.57 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  44.88 
 
 		 970 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  33.9 
 
 		 879 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  36.42 
 
 		 1028 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  38.46 
 
 		 1707 aa  186  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  30.18 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  29.02 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  35.79 
 
 		 794 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  44.03 
 
 		 737 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  31.01 
 
 		 511 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  25.68 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  60.98 
 
 		 41 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  37.04 
 
 		 365 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  28.4 
 
 		 333 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.66 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  30.95 
 
 		 328 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  25.79 
 
 		 352 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>