64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02714 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  924    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  70.23 
 
 
462 aa  669    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  72.91 
 
 
461 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  95.71 
 
 
460 aa  892    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  62.93 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  63.16 
 
 
473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  62.39 
 
 
475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  62.93 
 
 
470 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  60.54 
 
 
475 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  60.32 
 
 
475 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  60.77 
 
 
475 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  60.32 
 
 
475 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  60.32 
 
 
475 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  58.73 
 
 
475 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  56.75 
 
 
471 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  52.43 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  52.21 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  52.64 
 
 
517 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  51.99 
 
 
502 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  53.78 
 
 
469 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  51.66 
 
 
502 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  50.45 
 
 
503 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  49.57 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  50 
 
 
492 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  48.78 
 
 
501 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  48.43 
 
 
479 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  48.34 
 
 
475 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  48.87 
 
 
471 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  48.66 
 
 
512 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  47.97 
 
 
560 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  47.76 
 
 
562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  47.42 
 
 
491 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  48.88 
 
 
512 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  45.81 
 
 
503 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  44.37 
 
 
452 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  45.37 
 
 
517 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  46.74 
 
 
480 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  45.76 
 
 
528 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  43.4 
 
 
450 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  43.28 
 
 
418 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  41.84 
 
 
459 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  43.36 
 
 
456 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  37.8 
 
 
548 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  37.83 
 
 
541 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  37.63 
 
 
541 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  41.61 
 
 
427 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  37.8 
 
 
543 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  37.63 
 
 
551 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  37.75 
 
 
542 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  37.22 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.17 
 
 
879 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  36.4 
 
 
538 aa  282  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  36.16 
 
 
539 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  40.62 
 
 
1028 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  37.86 
 
 
1707 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  37.59 
 
 
421 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  36.64 
 
 
970 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  34.76 
 
 
737 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  30.23 
 
 
472 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  35.56 
 
 
794 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  30.45 
 
 
511 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  26.07 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  24.27 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13401  hypothetical protein  56.1 
 
 
41 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>