155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2090 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  100 
 
 		 794 aa  1593    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  32.56 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  33.17 
 
 		 427 aa  171  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  32.58 
 
 		 970 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  39.38 
 
 		 1028 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  29.6 
 
 		 459 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  33.11 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.12 
 
 		 1707 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  41.75 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  30.23 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  32.33 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  31.62 
 
 		 475 aa  161  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  30.7 
 
 		 475 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  30.61 
 
 		 475 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  31.64 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  30.07 
 
 		 473 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  40.07 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  34.51 
 
 		 471 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  30 
 
 		 475 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  37.58 
 
 		 541 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  29 
 
 		 879 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  34.25 
 
 		 549 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  37.58 
 
 		 541 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  30.16 
 
 		 475 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  35.55 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  33.52 
 
 		 548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  36.67 
 
 		 528 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  29.93 
 
 		 475 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  38.93 
 
 		 418 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  36.7 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  33.06 
 
 		 539 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  33.01 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  32.15 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  31.68 
 
 		 502 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  28.47 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  31.69 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  29.36 
 
 		 460 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  35.79 
 
 		 551 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  31.21 
 
 		 502 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  29.86 
 
 		 517 aa  145  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  30.27 
 
 		 450 aa  145  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  35.56 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  33.55 
 
 		 538 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  29.48 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  29.21 
 
 		 461 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  30.26 
 
 		 470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  38.81 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  35.09 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  28.12 
 
 		 491 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  28.64 
 
 		 479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  30.12 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  30.27 
 
 		 541 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  29.9 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  29.32 
 
 		 560 aa  134  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  29.2 
 
 		 492 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  29.32 
 
 		 562 aa  132  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  36.1 
 
 		 512 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0795  thiol oxidoreductase-like  33.23 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  29.72 
 
 		 737 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  28.88 
 
 		 421 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  27.3 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3543  thiol oxidoreductase-like  30.54 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00122263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6445  thiol oxidoreductase-like protein  28.24 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  28.64 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  29.01 
 
 		 369 aa  55.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 		 347 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 330 aa  55.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  31.65 
 
 		 333 aa  54.7  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 333 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 333 aa  54.7  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  31.78 
 
 		 348 aa  53.9  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  30.22 
 
 		 333 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.17 
 
 		 345 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  30.07 
 
 		 509 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  28.17 
 
 		 1577 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.61 
 
 		 652 aa  53.5  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 344 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 344 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  32.45 
 
 		 347 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  32.45 
 
 		 347 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 344 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  37.9 
 
 		 308 aa  52  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 344 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 425 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  29.69 
 
 		 345 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 		 359 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  30.22 
 
 		 333 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  39.74 
 
 		 466 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  30.95 
 
 		 330 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  44.33 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  31.52 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  30.71 
 
 		 346 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  40.96 
 
 		 360 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  31.14 
 
 		 427 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  33.85 
 
 		 350 aa  50.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  30.66 
 
 		 365 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  25.56 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>