132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  73.53 
 
 		 467 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  73.41 
 
 		 469 aa  690    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  78.63 
 
 		 467 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  72.29 
 
 		 470 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  76.36 
 
 		 464 aa  737    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  70.97 
 
 		 466 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  100 
 
 		 465 aa  952    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  70.92 
 
 		 451 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  58.11 
 
 		 467 aa  551  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.04 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  57.77 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  55.56 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  54.37 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  53.66 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  54.77 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  38.28 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  42.98 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.71 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.95 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  37.3 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  34.04 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  32.61 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  35.19 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  36.79 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  30.82 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  36.79 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.59 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  31.01 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.97 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.38 
 
 		 594 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.07 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  32.54 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.78 
 
 		 652 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.32 
 
 		 379 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.58 
 
 		 821 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.52 
 
 		 357 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  28.12 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 		 360 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  32.58 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 594 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  32.5 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  34.62 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  31.91 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  31.9 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  25.66 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  27.81 
 
 		 616 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  22.84 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  26.04 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.27 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  33.62 
 
 		 827 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  33.58 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 346 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.58 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  27.78 
 
 		 343 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  31.52 
 
 		 794 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  32.76 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  28.05 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  32.31 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  31.15 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  29.22 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  30.14 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.69 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  30.2 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.24 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 335 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  25.71 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.97 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  37.84 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  31.09 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.62 
 
 		 598 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 371 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  31.93 
 
 		 333 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  28.17 
 
 		 970 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  25.19 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  34 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  27.89 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.2 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  30.25 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.17 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  25.93 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  30.46 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>