87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4851 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  100 
 
 		 390 aa  793    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  59.21 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  47.38 
 
 		 458 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  46.95 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  47.5 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  46.88 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  46.95 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  46.95 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  42.49 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  26.71 
 
 		 567 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  34.25 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  38.62 
 
 		 827 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  31.43 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  32.86 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  39.22 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  33.57 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  31.51 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  34.31 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  37.04 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  37.78 
 
 		 467 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  35.38 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  33.85 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  25.68 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.86 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  38.52 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  29.93 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  33.77 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.14 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  38.55 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  40.91 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  33.7 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  33.04 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.09 
 
 		 1577 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  34.29 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  30.71 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 		 302 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  30.69 
 
 		 513 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  30.69 
 
 		 513 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.33 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  30.08 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  29.63 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  44.64 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  29.51 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  32.33 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  27.01 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.61 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  29.03 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  25.97 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  30.43 
 
 		 532 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  33.93 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.84 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  25.3 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  29.49 
 
 		 794 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  27.43 
 
 		 628 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  41.07 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  23.02 
 
 		 522 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  27.74 
 
 		 645 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  34.58 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  34.48 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  25.32 
 
 		 653 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.33 
 
 		 974 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  24.68 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  26.42 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  29.82 
 
 		 622 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  26.75 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  27.05 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  34.34 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  23.65 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  26.63 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  31.75 
 
 		 620 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  25.35 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  23.81 
 
 		 613 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  33.72 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.93 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  32.93 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  28.7 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.93 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.93 
 
 		 821 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>