132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4134 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  100 
 
 		 425 aa  871    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  58.9 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  47.74 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  46.63 
 
 		 458 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  47 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 465 aa  329  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  44.75 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  47.25 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  40.23 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  24.18 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  31.5 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  38.19 
 
 		 827 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  32.89 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.09 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  36.11 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  35.24 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  32.41 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  34.38 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  34.29 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  30.56 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  32.38 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.59 
 
 		 1577 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  32.3 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  32.38 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  30.34 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  32.41 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  32.41 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  26.95 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  27.78 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  26.95 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  31.36 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  27.97 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  31.21 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.83 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  52.73 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.93 
 
 		 821 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.08 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  30.53 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  36.36 
 
 		 332 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.46 
 
 		 974 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.11 
 
 		 311 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  26.13 
 
 		 653 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  32.11 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0943  di-haem cytochrome c peroxidase  33.96 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.832679  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  26.4 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.5 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  33.05 
 
 		 653 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  28.29 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00242  cytochrome C peroxidase  32.08 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 328 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  32.17 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 		 336 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  32.8 
 
 		 794 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.61 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  25 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.73 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  34.44 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  28.29 
 
 		 515 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  26.06 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  41.82 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  27.27 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  33.93 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  29.86 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  30.19 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  23.71 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.06 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  32.73 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  24.58 
 
 		 613 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.45 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  24.15 
 
 		 479 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  23.91 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  33.55 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  40 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  25.35 
 
 		 324 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  29.05 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  26.43 
 
 		 622 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  24.39 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  28.28 
 
 		 309 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 		 333 aa  46.6  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 333 aa  46.6  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  34.55 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  29.82 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  26.97 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  27.89 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  25.52 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  28.42 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  29.93 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>