119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2811 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  100 
 
 		 467 aa  967    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  74.4 
 
 		 469 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  72.12 
 
 		 467 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  72.86 
 
 		 470 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  70.85 
 
 		 451 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  72.13 
 
 		 464 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  76.1 
 
 		 466 aa  733    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  73.53 
 
 		 465 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  56.65 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.72 
 
 		 466 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  54.01 
 
 		 515 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  53.66 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  53.24 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  53.19 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  54 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.17 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.81 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  32.28 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.11 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  36.96 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  23.43 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.06 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.22 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  32 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.84 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  25.62 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  32 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.89 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.08 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 		 328 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 594 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 		 346 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.4 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.16 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.09 
 
 		 821 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.15 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.1 
 
 		 594 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  29.88 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  27.45 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  24.89 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  28.93 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  23.77 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  28.95 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 333 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  24.21 
 
 		 353 aa  50.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 626 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  26.58 
 
 		 616 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  27.35 
 
 		 344 aa  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  26.73 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  26.95 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  23.48 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  29.27 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  25.62 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  27.66 
 
 		 607 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  26.35 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.63 
 
 		 652 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  24.03 
 
 		 399 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  26.72 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  27.07 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  25.22 
 
 		 341 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  25.44 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  25.22 
 
 		 341 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.34 
 
 		 768 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  26.43 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.27 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  31.29 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  22.81 
 
 		 347 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  32.26 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  31.19 
 
 		 348 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  30.25 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  24.09 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  27.56 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  25.56 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  28.03 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  23.71 
 
 		 1577 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.91 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 		 521 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.19 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  27.66 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  25.45 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  27.12 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  25.62 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  25.9 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  24.33 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  29.8 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>