134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1094 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  74.4 
 
 		 467 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  100 
 
 		 469 aa  965    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  70.26 
 
 		 467 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  81.7 
 
 		 470 aa  806    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  72.04 
 
 		 451 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  69.76 
 
 		 464 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  74.07 
 
 		 466 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  73.41 
 
 		 465 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  58.3 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  60.18 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  54.28 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  54.05 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  53.54 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  54.4 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  53.7 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  34.53 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.87 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.39 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.55 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  32.77 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  28.72 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.56 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.88 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  24.1 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  31.09 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.2 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  23.28 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  31.09 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  23.6 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  23.6 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  24.45 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  29.66 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.9 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  32.06 
 
 		 358 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.72 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  32.73 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.8 
 
 		 821 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  31.54 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.01 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  29.05 
 
 		 613 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  25.35 
 
 		 323 aa  53.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.54 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.52 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  26.61 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  28.67 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  31.69 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  29.29 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  25 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.85 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  27.82 
 
 		 768 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.47 
 
 		 346 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  24.38 
 
 		 594 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  29.36 
 
 		 342 aa  50.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  27.33 
 
 		 626 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.92 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  26.47 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  23.2 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  25.86 
 
 		 1577 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.17 
 
 		 974 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  30.68 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  25.35 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  28.47 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  28.47 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  30.25 
 
 		 341 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  28.06 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  28.15 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  24.34 
 
 		 330 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  24.09 
 
 		 353 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  27.78 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  28.19 
 
 		 330 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  26.21 
 
 		 416 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  26.39 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  29.46 
 
 		 345 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  26.39 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  26.39 
 
 		 344 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  27.97 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  27.8 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  27.27 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1483  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  29.66 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0307027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.26 
 
 		 521 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  24.66 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  26.81 
 
 		 616 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>