44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4306 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  100 
 
 		 447 aa  910    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  66.67 
 
 		 458 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  61.26 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  64.23 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  64.23 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  63.73 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0518  hypothetical protein  59.12 
 
 		 490 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  47.13 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  47.03 
 
 		 425 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2098  hypothetical protein  32.62 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  37.3 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5501  hypothetical protein  31.46 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  36.97 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  35.19 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  28.84 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  34.13 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  35.14 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  31.55 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  35.19 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5356  hypothetical protein  32.26 
 
 		 653 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  33.33 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  27.1 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  33.58 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  33.07 
 
 		 353 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  28.83 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4871  hypothetical protein  31.61 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  30.28 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  31.61 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  27.96 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  28.32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2357  hypothetical protein  30.52 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  31.97 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  29.81 
 
 		 513 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  29.81 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  33.06 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  30.07 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.54 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  29.94 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  26.28 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  27.35 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.47 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>