118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3443 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0820  cytochrome c peroxidase  75.16 
 
 		 509 aa  744    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  70.61 
 
 		 515 aa  759    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0343  cytochrome c peroxidase  73.68 
 
 		 522 aa  740    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  96.69 
 
 		 513 aa  1029    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 513 aa  1060    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0488  cytochrome c Hsc  60.14 
 
 		 467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0694  cytochrome c Hsc  58.28 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  55.79 
 
 		 466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1094  cytochrome c Hsc  54.05 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4069  cytochrome c peroxidase-like protein  54.72 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00595006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2811  cytochrome c Hsc  53.66 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0138925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24860  cytochrome c Snr1  52.61 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2107  cytochrome c Snr1  52.61 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05680  Cytochrome c Catalase, CCC  54.37 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2341  cytochrome c peroxidase-like protein  52.84 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  36.29 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4134  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  32.86 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  36.36 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0490  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 458 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579921  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  34.15 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  33.86 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  28.48 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  25.84 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.42 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.22 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 		 594 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3151  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 594 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  25.81 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  27.78 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  29.75 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  29.27 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  29.75 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.08 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.79 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  26.74 
 
 		 334 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  24.44 
 
 		 634 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.47 
 
 		 367 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  28.06 
 
 		 369 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  27.08 
 
 		 592 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  32.58 
 
 		 359 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  33.64 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  29.37 
 
 		 571 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  32.73 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  32.73 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  26.97 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.36 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.48 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.85 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  28.37 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.91 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 330 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 344 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 344 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  26.72 
 
 		 348 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 		 613 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1954  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 465 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0503014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  28.57 
 
 		 329 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 330 aa  50.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.44 
 
 		 652 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  34.23 
 
 		 344 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  31.9 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.59 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.68 
 
 		 974 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 342 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  28.68 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  27.03 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  29.17 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  29.17 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  32.43 
 
 		 333 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 333 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4306  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 447 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.11 
 
 		 384 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  32.74 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06665  probable cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  30.91 
 
 		 338 aa  47.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.17 
 
 		 346 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  25.93 
 
 		 330 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  30.17 
 
 		 339 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  31.18 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  25.98 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  31.53 
 
 		 333 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  28.97 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  30.83 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  30.63 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  24.16 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.48 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>