173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1705 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1705  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1306    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.68 
 
 
821 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
974 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1291  putative surface layer protein, with cytochrome c domain  25.47 
 
 
620 aa  107  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.304881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6985  putative cytochrome c peroxidase  31.8 
 
 
329 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.36 
 
 
652 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  22.58 
 
 
827 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  24.73 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.34 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.27 
 
 
329 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  25.43 
 
 
365 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.45 
 
 
329 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.49 
 
 
366 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  22.71 
 
 
336 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  22.4 
 
 
1577 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.79 
 
 
354 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.5 
 
 
329 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.78 
 
 
335 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  25.77 
 
 
357 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.68 
 
 
354 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.41 
 
 
348 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 
321 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.28 
 
 
362 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.72 
 
 
348 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  23.55 
 
 
311 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.4 
 
 
362 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.16 
 
 
345 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 
326 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  29.73 
 
 
408 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
318 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.61 
 
 
324 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.22 
 
 
451 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.71 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  54.7  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 
354 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.05 
 
 
1667 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.68 
 
 
689 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40 
 
 
311 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  22.97 
 
 
580 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3443  cytochrome c peroxidase  24.44 
 
 
513 aa  53.9  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.41254e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.56 
 
 
971 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  23.44 
 
 
347 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.53 
 
 
299 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.4 
 
 
328 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  20.63 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.56 
 
 
314 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1998  Cytochrome-c peroxidase  23.78 
 
 
352 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.329942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  23.79 
 
 
353 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0818  cytochrome c peroxidase  24.44 
 
 
513 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0145275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  23.64 
 
 
347 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  21.43 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  25.31 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.84 
 
 
406 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  21.6 
 
 
345 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  21.33 
 
 
459 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.59 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.77 
 
 
365 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 
320 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  25.79 
 
 
330 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 
353 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 
348 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  24.53 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  21.34 
 
 
328 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.17 
 
 
819 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.17 
 
 
601 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.43 
 
 
345 aa  51.2  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.51 
 
 
818 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  19.71 
 
 
346 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  22.88 
 
 
331 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  22.6 
 
 
352 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  23.32 
 
 
464 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  21.15 
 
 
346 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7544  hypothetical protein  28.4 
 
 
395 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  19.33 
 
 
346 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1734  cytochrome c551 peroxidase  23.05 
 
 
271 aa  50.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.841983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  23.76 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.15 
 
 
328 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3266  cytochrome c Hsc  31.86 
 
 
466 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  28.57 
 
 
487 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.19 
 
 
415 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.42 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  18.96 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  30.33 
 
 
325 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6011  hypothetical protein  28.49 
 
 
395 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  21.99 
 
 
334 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  25.81 
 
 
329 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0679  cytochrome c peroxidase  25.55 
 
 
515 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5721  hypothetical protein  27.46 
 
 
395 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.08 
 
 
329 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6085  hypothetical protein  27.46 
 
 
395 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  20.3 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  22.18 
 
 
347 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.54 
 
 
391 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  25.27 
 
 
329 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.93 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  25.27 
 
 
329 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>